Persekusi adalah tindak penganiayaan yang dilakukan terhadap kelompok masyarakat tertentu, yang dianggap melakukan kritik terhadap kelompok lainnya. sekelompok orang menyerang kelompok lain yang bertentangan dengan ideologi kelompoknya, khususnya kelompok agama.
Dalam sejarah persekusi di Indonesia, yang paling menonjol adalah intoleransi terhadap jamaah Muslim Ahmadiyah. Pemerintah bahkan sampai membuat keputusan bersama tiga menteri untuk membahas permasalahan tersebut. Sangat disayangkan adalah sikap aparat kepolisian di banyak daerah tempat Ahmadiyah dipersekusi. Mereka seolah membiarkan teror dan intimidasi atas kebebasan beribadah. Bahkan kepolisian boleh dibilang tidak acuh dan membiarkan aksi persekusi warga lokal jika belum ada masyarakat yang melaporkan.
